Newsletter DPT Nro. 28

Fluorescencia para detección

Desarrollan un método ultrasensible de detección de ácidos nucleicos que puede aplicarse, por ejemplo, para detectar minúsculas cantidades de un virus en una muestra de sangre


En el laboratorio liderado por Jennifer Doudna, de la Universidad de California en Berkeley, se ha observado un fenómeno inesperado: cuando se corta una secuencia de ADN de doble cadena utilizando la proteína Cas12a, se desencadena el corte indiscriminado de todo el ADN de cadena sencilla.

Ello permite utilizar una molécula “indicadora” de cadena sencilla con la proteína CRISPR-Cas12a, la cual produce una señal fluorescente cuando ha encontrado su objetivo.

La enzima Cas12a corta ADN de doble cadena guiada por una molécula de ARN que se empareja con el gen diana deseado, pero luego se “descontrola” y comienza a cortar moléculas de ADN de cadena sencilla que puede haber en la mezcla de un tubo de ensayo.

Si se añaden compuestos fluorescentes que empiecen a brillar cuando estas hebras se cortan, el problema de “descontrol” se convierte en un extraordinario y ultrasensible método de detección de ácidos nucleicos, que puede aplicarse para detectar, por ejemplo, minúsculas cantidades de un virus en una muestra

Aprovechando este hallazgo, investigadores de UC Berkeley desarrollaron una plataforma de detección de ácidos nucleicos, llamada DETECTR, que puede identificar con éxito la presencia del virus del papiloma humano (VPH) (particularmente los tipos VPH16 y VPH18) en muestras clínicas, incluso con pequeñas cantidades de ADN.

Se prevé que la tecnología podrá aplicarse en el diagnóstico de múltiples enfermedades, incluido el cáncer y las enfermedades infecciosas

Fuente: “CRISPR-Cas12a target binding unleashes indiscriminate single-stranded DNase activity” Janice S. Chen, Enbo Ma, Lucas B. Harrington, María Da Costa, Xinran Tian, Joel M. Palefsky, Jennifer A. Doudna. Science 27 Apr 2018: Vol. 360, Issue 6387, pp. 436-439. DOI: 10.1126/science.aar6245