N.37 – Datos genéticos de cáncer

Las técnicas de secuenciación genómica de próxima generación (sigla en inglés: NGS) generan grandes cantidades de datos de ADN y ARN. La disponibilidad de tal abundancia de datos –a partir de diversas bases de datos públicas interoperables- contribuye a una creciente comprensión de la composición genética de las personas, así como de su predisposición a enfermedades como el cáncer.

Dado que los cambios en los patrones de metilación del ADN son cruciales en el desarrollo de enfermedades, en el artículo reseñado se propone combinar la metilación del ADN y la secuenciación de ARN en experimentos de NGS para la adquisición controlada de conocimiento en materia de cáncer.

Los autores recuperaron conjuntos de datos de metilación de ADN y de secuenciación de ARN del Atlas del Genoma del Cáncer (TCGA), centrándose en el carcinoma de mama invasivo, el carcinoma de tiroides y el carcinoma de células papilares renales. La comparación entre los conjuntos de genes obtenidos dio como resultado varios genes en común entre los diferentes experimentos, así como un conjunto de genes que aparecen en todos los tumores. Un análisis funcional preliminar habría confirmado la relación de esos genes con el cáncer.