N.58 – Software para medir la respuesta inmune

Investigadores del Instituto de Biología y Medicina Experimental (CONICET, IBYME) desarrollaron una herramienta bioinformática, llamada Mixture, que puede cuantificar –con alta precisión- la cantidad y el tipo de glóbulos blancos que se infiltran en tumores. Ello ayudará a explicar por qué fallan, en algunos casos, las inmunoterapias contra el cáncer.

El software está dotado de un algoritmo basado en aprendizaje automático (“machine learning”) que incorpora procesos de ciencia de datos para optimizar el análisis de datos biológicos a nivel molecular. Los investigadores analizaron con Mixture datos de biopsias tumorales -de mama (N: 703), pulmón (N: 526), cabeza y cuello (N: 494), melanoma (N: 401), y colorrectal (N: 452)- obtenidos del proyecto The Cancer Genome Atlas (TCGA).

Los resultados revelaron asociaciones entre la proporción de distintos tipos celulares inmunes infiltrando el tumor y distintas variables clínicas y genéticas. El estudio de la composición celular inmune del microambiente tumoral de los pacientes permitiría establecer nuevos biomarcadores para predecir mejor qué pacientes responderían a una determinada inmunoterapia.

Para todos los tipos de cáncer, los investigadores establecieron relaciones entre factores genéticos (que varían entre las personas) y el tipo y cantidad de células inmunes infiltradas en los tumores. Asimismo, determinaron de qué manera la asociación entre esas dos variables incide, a favor o en contra, en la respuesta de los pacientes a las inmunoterapias. Esta caracterización echa luz sobre potenciales terapias o estrategias de monitoreo del paciente. Mixture es de libre acceso a la comunidad científica y puede aplicarse a cualquier tipo de tumor.